WEKO3
アイテム
尿路由来大腸菌のフルオロキノロン耐性遺伝子についての解析
http://hdl.handle.net/10232/00030317
http://hdl.handle.net/10232/00030317885c08e3-629c-4e8b-b4cd-2fb8d3345a6e
名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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Diss_山根_隆史_ISK308_2014 (276.3 kB)
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Abstract_山根_隆史_4504810387_2014 (112.1 kB)
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Result_Yamane_Takashi_isk_308_2018 (812.1 kB)
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Comments_Yamane_Takashi_isk_308_2018 (397.5 kB)
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Item type | 学位論文 / Thesis or Dissertation(1) | |||||
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公開日 | 2018-08-01 | |||||
タイトル | ||||||
タイトル | Genome-wide transcriptome analysis of fluoroquinolone resistance in clinical isolates of Escherichia coli | |||||
タイトル言語 | en | |||||
タイトル | ||||||
タイトル | 尿路由来大腸菌のフルオロキノロン耐性遺伝子についての解析 | |||||
タイトル言語 | ja | |||||
著者 |
山根, 隆史
× 山根, 隆史 |
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言語 | ||||||
言語 | eng | |||||
キーワード | ||||||
主題言語 | en | |||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | Escherichia coli | |||||
キーワード | ||||||
主題言語 | en | |||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | fluoroquinolone resistance | |||||
キーワード | ||||||
主題言語 | en | |||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | microarray | |||||
資源タイプ | ||||||
資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_db06 | |||||
資源タイプ | doctoral thesis | |||||
アクセス権 | ||||||
アクセス権 | open access | |||||
アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||
要約 | ||||||
内容記述タイプ | Other | |||||
内容記述 | Objectives: Coincident with their worldwide use, resistance to fluoroquinolones in Escherichia coli has increased.To identify the gene expression profiles underlying fluoroquinolone resistance, we carried out genome-wide transcriptome analysis of fluoroquinolone-sensitiveE. coli. Methods: Four fluoroquinolone-sensitive E. coli and five fluoroquinolone-resistant E. coli clinical isolates were subjected to complementary deoxyribonucleic acid icroarray analysis. Some upregulated genes’ expression was verified by real-time polymerase chain reaction using 104 E. coli clinical isolates, and minimum inhibitory concentration tests were carried out by using their transformants. Results: A total of 40 genes were significantly upregulated influoroquinolone-resistant E. coli isolates (P<0.05). The expression of phage shock protein operons, which are involved in biofilm formation, was markedly upregulated in our profile of fluoroquinolone-resistant E. coli. One of the phage shock protein operons, pspC, was significantly upregulated in 50 fluoroquinolone-resistant E. coli isolates (P<0.0001). The expression of type I fimbriae genes, which are pilus operons involved in biofilm formation, were markedly downregulated in fluoroquinolone-resistant E. coli. Deoxyri-bonucleic acid adenine methyltransferase (dam), which represses type I fimbriae genes, was significantly upregulated in the clinical fluoroquinolone-resistant E. coli iso-lates (P=0.007). We established pspC- and dam-expressing E. coli transformants from fluoroquinolone-sensitive E. coli, and the minimum inhibitory concentration tests showed that the transformants acquired fluoroquinolone resistance, suggesting that upregulation of these genes contributes to acquiring fluoroquinolone resistance. Conclusions: Upregulation of psp operones and dam underlying pilus operons down-regulation might be associated with fluoroquinolone resistance in E. coli. |
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内容記述言語 | en | |||||
収録雑誌名 |
en : INTERNATIONAL JOURNAL OF UROLOGY 巻 19, p. 360-368, 発行日 2012 |
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権利 | ||||||
権利情報の言語 | en | |||||
権利情報 | © 2011 The Japanese Urological Association | |||||
情報源 | ||||||
識別子タイプ | URI | |||||
関連識別子 | https://onlinelibrary.wiley.com/journal/14422042 | |||||
関連名称 | INTERNATIONAL JOURNAL OF UROLOGY | |||||
出版タイプ | ||||||
出版タイプ | VoR | |||||
出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||
NDC | ||||||
主題Scheme | NDC | |||||
主題 | 491 | |||||
ファイル(説明) | ||||||
内容記述 | 博士論文全文, 博士論文要旨, 最終試験結果の要旨, 論文審査の要旨 | |||||
公開者・出版者 | ||||||
出版者 | The Japanese Urological Association | |||||
出版者言語 | en | |||||
公開者・出版者 | ||||||
出版者 | 鹿児島大学 | |||||
出版者言語 | ja | |||||
公開者・出版者 | ||||||
出版者 | カゴシマ ダイガク | |||||
出版者言語 | ja-Kana | |||||
関連(hasPart) | ||||||
関連タイプ | hasPart | |||||
識別子タイプ | URI | |||||
関連識別子 | https://doi.org/10.1111/j.1442-2042.2011.02933.x | |||||
備考 | ||||||
備考 | 【指導教員:中川昌之】 | |||||
学位名 | ||||||
学位名の言語 | ja | |||||
学位名 | 博士(医学) | |||||
学位名 | ||||||
学位名の言語 | en | |||||
学位名 | Doctor of Philosophy in Medical Science | |||||
学位授与機関名 | ||||||
学位授与機関識別子Scheme | kakenhi | |||||
学位授与機関識別子 | 17701 | |||||
学位授与機関名の言語 | ja | |||||
学位授与機関名 | 鹿児島大学 | |||||
学位授与年月日 | ||||||
学位授与年月日 | 2014-11-17 | |||||
学位授与番号 | ||||||
学位授与番号 | 甲総研第308号 |